針對咖啡豆的保存，不論是在專業烘豆師這一端，或是喜好自行購買生豆烘焙的咖啡饕客，咖啡達人王神寶建議，咖啡豆一經烘焙完成，需要快速裝罐、密封、熟成，並阻隔水氣受潮與惰性氣體流失，再裝入密封夾鏈袋中，且包裝最好選擇沒有透氣孔的夾鏈袋，以保有不活潑的惰性氣體來保護新鮮豆子，因此，常會有包裝袋膨脹情況，純屬自然現象，並非一般人以為的咖啡豆衰敗腐壞。
咖啡豆置於常溫保存即可
有些咖啡販售商會使用透氣孔解決膨袋問題，反而會缺乏惰性氣體的保護作用。購買已烘焙完成的咖啡豆回家之後，咖啡豆置於常溫保存即可，但要留意避免靠近熱源，否則容易因高溫出油而使咖啡豆老化劣變；同時，不宜將咖啡豆放在冰箱保存，會造成取出時易受潮，而且低溫會使得咖啡熟豆中的油脂結凍，反而影響咖啡豆的熟成，也影響咖啡的風味。
咖啡達人王詩鈺指出，咖啡豆的保存以防潮、防曬、密封、避免溫度變化為主，目前市售咖啡豆的包裝袋大都具有阻隔陽光、空氣、密封的效果，開封後可再外加密封袋、使用密封罐，或放在防潮箱內，封存的效果會更好。最好採取少量購買、要喝再研磨的原則，若是家中沒有磨豆機，可分次請業者代研磨，或即使一次研磨後採分袋封存，每次用一小袋，如此可減少咖啡豆、粉與空氣接觸氧化的機會。
保存期不超過3個月
經過不斷測試，王神寶認為咖啡的賞味期，以烘焙日起算的3 個月內為最佳，越接近烘焙日期飲用，新鮮度當然越好。王詩鈺提醒，咖啡豆只要還沒有開封，可以依照咖啡豆商所標示的保存期限，但一旦開封，最好的狀態是能在兩星期之內就將咖啡豆沖煮、飲用完畢，特別是烘焙程度越深重的，密封保存要越仔細，保存期限更要縮短，最好趕快喝完，因為重烘焙的咖啡豆油脂較多，容易產生油耗味，與空氣接觸易加速氧化。
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