中央流行疫情指揮中心撤銷金門縣政府公告的「快篩令」，縣長楊鎮浯表達抗議，指出縣府兩度去函申請快篩站，遭中央已讀不回。對此，指揮官陳時中回應，確實有收到金門縣府的發函，但這樣的方式不理想，而且於法不合才會撤銷。不過陳時中也認為，「當然他想法上也有一點沒有錯，希望人的流動不要太頻繁。」
金門縣政府23日宣布，要求入境金門旅客必須提供3天內檢驗陰性報告，否則就要當場接受快篩，但這項快篩令依《傳染病防治法》遭到指揮中心撤銷。而金門航空站今（24）天一早也把快篩站拆除，讓縣長楊鎮浯氣得大發雷霆。
陳時中在疫情記者會上表示，金門縣政府事實上是有發函來，也有在防疫會議中提出相關建議，希望指揮中心在台灣往離島航線機場設置新冠肺炎篩檢站，並且要求旅客3日內陰性檢驗報告證明才能去離島，以保全離島醫療。陳時中指出，在會議中就已告知這樣的方式不理想，而且會造成「區隔」，如果大家都執行的話，恐怕台灣一日生活圈都會遭到破壞。
不過陳時中也幫忙緩頰，「這個想法也沒有錯，希望人的流動不要太頻繁，造成防疫壓力」，但手段上是否要如此強烈，指揮中心認為還要由專家來研議，這種方式是大家不同意的。
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